استنادًا إلى مبدأ التكامل بين القطاعين الخاص والعام في تقديم خدمات التعليم العالي في المملكة العربية السعودية، تشجع وزارة التعليم العالي التعليم الخاص في جميع التخصصات الأكاديمية. وقد شجع صاحب السمو الملكي الأمير فهد بن سلطان، أمير منطقة تبوك، المستثمرين على إنشاء جامعة خاصة لنشر الثقافة والتعليم في مدينة تبوك التي تتمتع بموقع جغرافي متميز يخدم المنطقة والمناطق المحيطة بها.
تأسست جامعة فهد بن سلطان في عام 1424 هـ في مدينة تبوك مع كلية واحدة هي كلية الحوسبة. وفي بداية العام الدراسي 1427-1428 هـ، تم إضافة فرع للبنات، تلاها إضافة كليتين هما كلية الهندسة وكلية الأعمال والإدارة في العام 1428-1429 هـ. يتم إدارة الجامعة من قبل مجلس أمناء يرأسه صاحب السمو الملكي الأمير فهد بن سلطان بن عبد العزيز. ويتكون المجلس من خمس كليات تقدم ثمانية برامج بكالوريوس تمنح درجة البكالوريوس في أحد عشر تخصصًا، بالإضافة إلى ستة برامج دراسات عُليا تمنح درجة الماجستير في أكثر من خمسة عشر تخصصًا.
